MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	GCT	2	6	458	463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496809
2	NC_014017	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496809
3	NC_014017	GAC	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496809
4	NC_014017	CGA	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496809
5	NC_014017	CG	3	6	699	704	0 %	0 %	50 %	50 %	294496809
6	NC_014017	GTCA	2	8	840	847	25 %	25 %	25 %	25 %	294496809
7	NC_014017	GCC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496809
8	NC_014017	GCG	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496809
9	NC_014017	GTG	3	9	1069	1077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496810
10	NC_014017	TGA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496810
11	NC_014017	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
12	NC_014017	TTA	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496810
13	NC_014017	C	6	6	1193	1198	0 %	0 %	0 %	100 %	294496810
14	NC_014017	AT	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
15	NC_014017	AT	3	6	1243	1248	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
16	NC_014017	TAAG	2	8	1255	1262	50 %	25 %	25 %	0 %	294496810
17	NC_014017	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496810
18	NC_014017	GTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496810
19	NC_014017	AAT	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496810
20	NC_014017	AGCC	2	8	1805	1812	25 %	0 %	25 %	50 %	294496811
21	NC_014017	ATC	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496811
22	NC_014017	GGT	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
23	NC_014017	TGC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496811
24	NC_014017	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496811
25	NC_014017	TGC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496811
26	NC_014017	TGG	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
27	NC_014017	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
28	NC_014017	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496811
29	NC_014017	GCAG	2	8	2237	2244	25 %	0 %	50 %	25 %	294496811
30	NC_014017	A	7	7	3803	3809	100 %	0 %	0 %	0 %	294496812
31	NC_014017	TTC	2	6	4273	4278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496813
32	NC_014017	AGAA	2	8	4317	4324	75 %	0 %	25 %	0 %	294496813
33	NC_014017	T	7	7	4368	4374	0 %	100 %	0 %	0 %	294496813
34	NC_014017	TC	3	6	4396	4401	0 %	50 %	0 %	50 %	294496813
35	NC_014017	TTC	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496813
36	NC_014017	GTA	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496813
37	NC_014017	ATT	2	6	4498	4503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496813
38	NC_014017	CAGCC	2	10	4585	4594	20 %	0 %	20 %	60 %	294496813
39	NC_014017	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496813
40	NC_014017	GA	4	8	4623	4630	50 %	0 %	50 %	0 %	294496813
41	NC_014017	TCG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
42	NC_014017	TCA	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
43	NC_014017	ACCA	2	8	4777	4784	50 %	0 %	0 %	50 %	294496813
44	NC_014017	CTG	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
45	NC_014017	ACG	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496813
46	NC_014017	TAA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496813
47	NC_014017	TGC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
48	NC_014017	TTCC	2	8	5030	5037	0 %	50 %	0 %	50 %	294496813
49	NC_014017	AAGC	2	8	5085	5092	50 %	0 %	25 %	25 %	294496813
50	NC_014017	CCG	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496813
51	NC_014017	CAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
52	NC_014017	AATT	2	8	5157	5164	50 %	50 %	0 %	0 %	294496813
53	NC_014017	TCA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
54	NC_014017	AGC	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
55	NC_014017	GTCA	2	8	5358	5365	25 %	25 %	25 %	25 %	294496814
56	NC_014017	AAC	2	6	5370	5375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
57	NC_014017	TCCA	2	8	5419	5426	25 %	25 %	0 %	50 %	294496814
58	NC_014017	GACT	2	8	5431	5438	25 %	25 %	25 %	25 %	294496814
59	NC_014017	CCG	2	6	5567	5572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496814
60	NC_014017	CAG	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
61	NC_014017	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496814
62	NC_014017	GACT	2	8	5673	5680	25 %	25 %	25 %	25 %	294496814
63	NC_014017	AGC	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
64	NC_014017	TAA	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496814
65	NC_014017	AAG	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496814
66	NC_014017	AGC	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
67	NC_014017	ATC	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496814
68	NC_014017	ATA	2	6	5850	5855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496814
69	NC_014017	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
70	NC_014017	TCT	2	6	5869	5874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496814
71	NC_014017	ATCA	2	8	5940	5947	50 %	25 %	0 %	25 %	294496814
72	NC_014017	CCAT	2	8	5972	5979	25 %	25 %	0 %	50 %	294496814
73	NC_014017	GATGTC	2	12	5995	6006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294496814
74	NC_014017	CAC	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496814
75	NC_014017	AAC	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
76	NC_014017	TTTGG	2	10	6061	6070	0 %	60 %	40 %	0 %	294496814
77	NC_014017	TGGA	2	8	6112	6119	25 %	25 %	50 %	0 %	294496814
78	NC_014017	CAG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
79	NC_014017	AGC	2	6	6267	6272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
80	NC_014017	AC	3	6	7480	7485	50 %	0 %	0 %	50 %	294496815
81	NC_014017	CCA	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496815
82	NC_014017	AT	3	6	7595	7600	50 %	50 %	0 %	0 %	294496815
83	NC_014017	CA	3	6	7607	7612	50 %	0 %	0 %	50 %	294496815
84	NC_014017	GCCA	2	8	7745	7752	25 %	0 %	25 %	50 %	294496815
85	NC_014017	CAC	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496815
86	NC_014017	CAG	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496815
87	NC_014017	CTG	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496815
88	NC_014017	GCT	2	6	7808	7813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496815
89	NC_014017	GGC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496815
90	NC_014017	TCA	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496816
91	NC_014017	CTGC	2	8	7994	8001	0 %	25 %	25 %	50 %	294496816
92	NC_014017	TTTCCA	2	12	8015	8026	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294496816
93	NC_014017	CTT	3	9	8108	8116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496816
94	NC_014017	CCGG	2	8	8421	8428	0 %	0 %	50 %	50 %	294496817
95	NC_014017	CTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496817
96	NC_014017	GAA	2	6	8462	8467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496817
97	NC_014017	TGTT	2	8	8489	8496	0 %	75 %	25 %	0 %	294496817
98	NC_014017	TG	3	6	8504	8509	0 %	50 %	50 %	0 %	294496817
99	NC_014017	GCC	2	6	8549	8554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496817
100	NC_014017	GTG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496817
101	NC_014017	CAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496817
102	NC_014017	GCC	2	6	8666	8671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496817
103	NC_014017	GCA	2	6	8747	8752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496817
104	NC_014017	TCT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496817
105	NC_014017	G	6	6	8898	8903	0 %	0 %	100 %	0 %	294496817
106	NC_014017	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	294496817
107	NC_014017	ATA	2	6	9611	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
108	NC_014017	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496818
109	NC_014017	GAT	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496818
110	NC_014017	ATA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
111	NC_014017	TCA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496818
112	NC_014017	T	7	7	9715	9721	0 %	100 %	0 %	0 %	294496818
113	NC_014017	TCA	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496818
114	NC_014017	AG	3	6	9743	9748	50 %	0 %	50 %	0 %	294496818
115	NC_014017	T	6	6	9787	9792	0 %	100 %	0 %	0 %	294496818
116	NC_014017	ATT	2	6	9853	9858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496818
117	NC_014017	ATA	2	6	9957	9962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
118	NC_014017	AACA	2	8	10008	10015	75 %	0 %	0 %	25 %	294496818
119	NC_014017	AGT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496818
120	NC_014017	TCT	2	6	10061	10066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496818
121	NC_014017	TATT	2	8	10074	10081	25 %	75 %	0 %	0 %	294496818
122	NC_014017	TAA	2	6	10143	10148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496818
123	NC_014017	ATT	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496819
124	NC_014017	CCA	2	6	10809	10814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496819
125	NC_014017	GCA	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496819
126	NC_014017	GA	3	6	10957	10962	50 %	0 %	50 %	0 %	294496819
127	NC_014017	TTC	2	6	11022	11027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496819
128	NC_014017	ATA	2	6	11033	11038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496819
129	NC_014017	GGCG	2	8	11138	11145	0 %	0 %	75 %	25 %	294496819
130	NC_014017	ACG	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496819
131	NC_014017	ATT	2	6	11344	11349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496819
132	NC_014017	A	7	7	11390	11396	100 %	0 %	0 %	0 %	294496819
133	NC_014017	TC	3	6	11401	11406	0 %	50 %	0 %	50 %	294496819
134	NC_014017	GCG	2	6	11432	11437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496819
135	NC_014017	GTG	2	6	11454	11459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496819
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263	NC_014017	T	6	6	20096	20101	0 %	100 %	0 %	0 %	294496828
264	NC_014017	GGT	2	6	20142	20147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496828
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267	NC_014017	T	7	7	20261	20267	0 %	100 %	0 %	0 %	294496828
268	NC_014017	TGG	2	6	20288	20293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496828
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331	NC_014017	AG	3	6	23397	23402	50 %	0 %	50 %	0 %	294496830
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388	NC_014017	G	9	9	26741	26749	0 %	0 %	100 %	0 %	294496835
389	NC_014017	TGCT	2	8	26760	26767	0 %	50 %	25 %	25 %	294496835
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400	NC_014017	GCTT	2	8	27616	27623	0 %	50 %	25 %	25 %	294496836
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425	NC_014017	TGA	2	6	28370	28375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496837
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